কর্ণফুলী রক্ষার বদলে দেশের অর্থনৈতিকভাবে গুরুত্বপূর্ণ নদীটি নিয়ে চট্টগ্রাম বন্দর কর্তৃপক্ষ ব্যবসা করছে বলে অভিযোগ করেছেন চট্টগ্রাম নদী ও খালরক্ষা আন্দোলনের বিশেষজ্ঞরা। সংগঠনটি বলছে, মহাপরিকল্পনা উপেক্ষা করে নদীর তীর লিজ দিয়ে দখল উৎসাহিত করা এবং অপরিকল্পিত খনন নদীটিকে অস্তিত্ব সঙ্কটে ফেলেছে।